A rendszerek részrendszerekre bontó eljárásaiban figyelembe kell venni ezek egymásra ható kapcsolódásait. Jellegzetes példák a tározó rendszerek, így a víz és gáztározók, de hasonló feladatok adódnak a biológiai szervezetek egymásra hatásában is.
A kapcsolódások alapesetei a párhuzamos és a soros kapcsolat. A villamos áramkörök példájára történik ezek ábrázolása és a kapcsolódás eredményének modellszámítása. A természetből vett példákban sorosak az emésztőrendszer kapcsolódásai és ezek sorba kapcsolva a párhuzamosan működő két veseféllel. A párhuzamos kapcsolást egy gázgyár egyedi rendszerein is mutatjuk, a berendezéseket a szükségleteknek megfelelően kapcsolják. Az egyes egységeken belül viszont a folyamat soros.
A kapcsolódások különlegesen fontos és érdekes formája a visszacsatolás. Ezzel külön témaként foglalkozunk.
A részrendszerek kapcsolódásait a blokkvázlatok kapcsolódásaival szemléltethetjük (lásd a 36. oldal oktatási felületét). Ezek segítségével vizsgálhatjuk az eredő rendszer viselkedését, de belső jeleinek alakulását is.