A modellek építése a hasonlóságok és a különbözőségek felismerése alapján történik. Ez is régi recept, az arisztotelészi meghatározást általában latin fordításban használták főleg a növény- és állatvilág rendszerezésében: genus proximum, azaz a legközelebbi fajta és a differentia specifica, a sajátos különbség felismerése. A módszer eredményeinek folyamatos felülvizsgálata része a modellek alkalmazhatóságának.
A repülőgép és a madár bizonyos alkalmazásokban hasonló lehet, más lényeges vonatkozásokban, pl. hogy természetes vagy mesterséges objektumok, élőlények, vagy gépek, élesen különböző. Az agykutatás egyes eredményei azt mutatják, hogy a modellfogalmak és a jelenségekkel kapcsolódó részletek valahogy így, sokfajta asszociációs kapcsolódással működnek a neurális rendszerekben.